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1、可购买的险种不同：
首先个人社保代缴就是去找一家正规的人力资源机构去给自己缴纳五险，但是在个人窗口缴费只能缴纳养老保险、医疗保险这两种，失业保险、工伤保险和生育保险是无法自己购买的。
2、社保缴费的比例不同：
五险的缴费总额=社保缴费基数×(养老保险比例+医疗保险比例+失业保险比例+生育保险比例+工伤保险比例)，其中养老、医疗和失业保险是由个人和企业承担的。如果在人力资源机构办理个人社保代缴的话，这一块费用全由自己承担，个人窗口缴费只能缴纳养老、医疗，并且他们的缴费基数和档位都是固定的，不能像找社保代缴档位去缴纳那样灵活自由。
3、享受险种待遇不同：
个人窗口缴费享受医疗保险、养老保险，找个人社保代缴公司缴纳社保可以享受五险。
4、退休后待遇不同：
累计买满养老保险15年后，男性公民，无论是个人窗口缴费还是找单位代缴其退休养老金的年龄均在60岁之后;而女性则有区别，在单位工作且由单位参保的普通女职工在50岁可领取，在职女干部需55岁退休后方可领取，但在个人窗口缴费参保的女性不论各种均需要55岁才可以领取。
